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怎么用R語言ggplot2畫氣泡圖來展示基因表達(dá)量，相信很多沒有經(jīng)驗(yàn)的人對(duì)此束手無策，為此本文總結(jié)了問題出現(xiàn)的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個(gè)問題。
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今天重復(fù)的內(nèi)容是論文中的figure2f
今天的推文主要介紹其中的氣泡圖，明天的推文介紹如何向氣泡圖上疊加樹形圖
按照論文提供的代碼得到了畫圖用到的數(shù)據(jù)，部分?jǐn)?shù)據(jù)如下
但是用他提供的畫圖代碼沒有能夠畫出圖來。因?yàn)樗玫搅艘粋€(gè)dot_plot()函數(shù)，沒有找到這個(gè)函數(shù)是怎么來的。既然已經(jīng)拿到了數(shù)據(jù)，就用ggplot2自己來畫吧
data.final<-read.csv("NM/figure2f.csv",header=T)
head(data.final)
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point()
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point(aes(size=`Percent expressed`,
color=`Average expression`))
包括
去掉灰色背景 調(diào)整坐標(biāo)軸字體方向 去掉坐標(biāo)軸標(biāo)題 更改配色
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point(aes(size=`Percent expressed`,
color=`Average expression`))+
theme_bw()+
theme(panel.grid = element_blank(),
axis.text.x=element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5))+
scale_color_gradient(low="lightgrey",high="blue")+
labs(x=NULL,y=NULL)
看完上述內(nèi)容，你們掌握怎么用R語言ggplot2畫氣泡圖來展示基因表達(dá)量的方法了嗎？如果還想學(xué)到更多技能或想了解更多相關(guān)內(nèi)容，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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文章起源：http://www.ef60e0e.cn/article/gosjsc.html
