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如何在centos 5.8安裝網(wǎng)卡JMicron JMC250驅動?
使用驅動精靈檢測一下,并下載修復就可以了.
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祝你好運,希望你能采納
如何準備pdbq和pdbqs文件
這里,mol2topdbqs是為受體轉化為pdbqs文件。一般來說,mol2是比較通用的文件格式。不過,由于autodock需要考慮受體的溶劑化效應,所以在autodock中用于對接的小分子需要pdbq與pdbqs格式。在autodock中有個程序為mol2topdbqs,可以直接轉化mol2文件為pdbqs文件。
在不同運行平臺,由于awk的版本不同,運行略有不同。
比如,在sgi irix中,直接使用mol2topdbqs命令就可以。這個其實是由兩個命令構成的:
%mol2topdbq macro.mol2 macro.pdbq
%addsol macro.pdbq macro.pdbqs
但是在linux中,這個命令提示出錯。不過,這個命令分解為兩個命令就可以:
$mol2fftopdbq macro.mol2 macro.pdbq
$addsol macro.pdbq macro.pdbqs
對于小分子配體文件,要用deftors命令。
用法
$deftors lig.mol2
會提示定義環(huán),選1-c-c就可以了。
這是針對單個配體文件來說的,如果對于數(shù)據(jù)庫中的多個小分子,就需要編寫循環(huán)腳本批量操作了。
nci-3d中有已經(jīng)準備好的pdbq格式的小分子,可以直接用于autodock的對接。我想你可以參考他們的批量轉化方法。
在autodock運行中,最占時間的是格點(grid)參數(shù)的計算。而每個小分子與受體作用的格點參數(shù)都是不同的。在JMC的兩篇文章中(J Med Chem. 2005, 48: 2308-2318;J Med Chem. 2006, 49: 2417-2430),同一個課題組發(fā)表了兩篇文章,主要是以P450酶為靶點,對autodock的源代碼進行修改,使不同原子類型的格點參數(shù)計算一次完成,然后,不同的小分子可以隨時調用計算好的格點參數(shù)用于對接。這樣就解決了虛擬篩選中每個分子重復計算格點參數(shù)的速度問題。
在最近的一篇文章中(proteins,200665:549-554),一個韓國課題組發(fā)表文章,利用autodock進行虛擬篩選,文章沒有對格點計算方法進行詳述,不過據(jù)我推想,他們應該也采用了jmc兩篇文章的方法。
jmc文章作者修改后的autodock源代碼可以通過發(fā)郵件聯(lián)系得到。同時,他們還通過修改源代碼,實現(xiàn)了將水分子中氧上的氫鍵接受作用考慮在分子對接中(在原代碼中,只能考慮水分子的氫鍵供體作用)。
上海藥物所曾經(jīng)在論壇中發(fā)過一段腳本,通過循環(huán)來利用autodock進行虛擬篩選。這個極有參考意義。不過腳本中需要對數(shù)據(jù)庫中的每個小分子都計算格點能,這可能會使虛擬篩選時間大大延長。
騰訊牛逼!終于開源了自家的 JDK——Kona
是的,繼阿里 2019/03 開源基于 OpenJDK 的長期支持版本 Alibaba Dragonwell 之后,騰訊也發(fā)布了自家的開源免費的 JDK 版本—— Tencent Kona ,必須替小馬哥宣傳一波。
看了下 Github 騰訊開源版 JDK 的發(fā)布記錄:
最早是在 2019/11/04 這天發(fā)布的 Tencent Kona v8.0.0 版本,沒錯,最近棧長村里通網(wǎng)了,最近才知道騰訊自家版 JDK 這個東東,不辦法,我是村網(wǎng)通,我為我自己帶鹽。
Tencent Kona 是騰訊開源的、免費的、基于 OpenJDK 的發(fā)行版本,并且受騰訊長期支持(LTS)和季度更新,目前由騰訊專業(yè)的 JVM 技術團隊進行維護和開發(fā)。
開源地址:
在騰訊內部,Kona 就是默認使用的 JDK,主要應用于騰訊云業(yè)務場景及其他 Java 應用場景,并且針對超大規(guī)模的大數(shù)據(jù)、機器學習和云計算進行了深度優(yōu)化。
另外,Kona 還為那些想用 OpenJDK 的客戶和合作伙伴提供一個基于 OpenJDK 的構建、長期維護支持的騰訊版 OpenJDK 版本。
為什么是 Tencent Kona 8?
因為騰訊 Kona-8 是基于 OpenJDK 8 開發(fā)的,所以叫 Kona-8,8 這個數(shù)字是跟 OpenJDK 的版本走的。
Tencent Kona 當前只支持 Linux/x86_64 平臺,現(xiàn)在絕大部分企業(yè)系統(tǒng)應用都運行在這個平臺,不是面向基礎用戶,所以沒有必要再開發(fā) Windows 這種沒有意義的多余的維護成本。
騰訊 Kona 基于 OpenJDK 提供了許多的擴展功能及維護特性,通過騰訊 Kona 可以獲得更為先進的功能及性能優(yōu)化,進而提高用戶和開發(fā)者的使用體驗。
Tencent Kona 8 主要支持以下兩個特性:
這個特性用于提高 JVM 的啟動速度, 默認為打開狀態(tài),可以通過以下命令啟動打開/關閉該特性:
這個特性用于采集 Java 應用程序的診斷信息,默認為關閉狀態(tài)。
啟動的時候可以通過以下命令啟用 JFR :
應用程序運行時,使用以下命令采集 JFR 數(shù)據(jù):
使用以下命令停止 JFR 采集數(shù)據(jù):
JFR 數(shù)據(jù)處理可以使用 java mission control (jmc) 7.0以上版本打開*.jfr文件,更多可以參考 Oracle 的 JFR 官方文檔。
下載最新的騰訊 Kona 二進制文件,地址:
和官方命令一樣用 java -version 查看版本:
Oracle JDK 的收費,從網(wǎng)上就可以看到很多用戶抱怨不止,畢竟 Oracle JDK 收費版的支持維護費用不是一般企業(yè)和個人能負擔得起的,很多企業(yè)和個人開發(fā)者也從而轉向其他的免費開源 JDK 版本。
大廠一方面是有錢、有精力、有技術實力,另一方面 Oracle JDK 也不一定符合咱們互聯(lián)網(wǎng)大廠的性能要求,如果把收費的錢用來搞自研,不用受制于人,不是更香?所以,為什么大廠都搞定制 JDK 也就不奇怪了。
可以看到的趨勢,未來將會有越來越多的企業(yè)和 Java 開發(fā)者進而放棄 Oracle JDK,轉而使用 OpenJDK 或者其他開源 復本 ,又或者基于 OpenJDK 進行自家定制,當然這得有技術實力、有錢的大廠才行。
隨著各大廠都推出自家的 JDK,Oracle JDK 的收費之路還能走多遠?
最后,你們用的哪個 JDK 版本呢?歡迎留言討論分享
如果有幫助,點個在看鼓勵一下哦!也歡迎分享轉發(fā)給更多有需要的朋友
jdk的配置
JDK 安裝
Java實際上分為三個版本:
J2ME:Java 2 Micro Edition,適用于移動端的微型版本,曾廣泛應用于機頂盒、車載系統(tǒng)、移動數(shù)字電話、個人數(shù)字助理(PDA)以及一系列嵌入式設備中,和大家接觸最多的便是前幾年的手機上搭載的J2SE環(huán)境,它幾乎支撐了智能手機游戲的半邊天。
J2SE:Java 2 Standrad Edition,Java標準版本,只包含基礎的Java類庫,適用于在桌面端構建Java程序。它是J2ME和J2EE的基礎。
J2EE:Java 2 Enterprise Edition,Java企業(yè)版本,包含很多企業(yè)級特性,適用于簡化企業(yè)開發(fā)的版本,包含一系列特性,如EJB、JAXB、JDBC API、CORBA、Servlet、JSP等等,實際上我們今天使用的JDK名義上是J2SE,但實際上他已經(jīng)混入了J2EE的很多特性,算得上是J2EE版本了。
PS:Java在1.2版本之后統(tǒng)稱為Java 2。當然,在當下“Java”這種叫法已經(jīng)是熟路的叫法了。
我們在開發(fā)中一般安裝的是J2SE,若需要J2EE的一些特性我們一般是通過Maven去關聯(lián)支持類庫的。
JRE和JDK的區(qū)別
JRE是Java運行環(huán)境,只包含了Java程序運行時所需要的一系列類庫(Binary),他可以被精簡至更小。JDK則是Java開發(fā)包,除了包含一整套JRE還包含有一些列為開發(fā)者提供的工具(命令行工具和GUI工具)用于管理Java程序(jjs、jmc、jps、jvisualvm、jstatck、jhat、jdoc等等一系列工具),還包含大部分內置類庫的源碼(包括Native方法的源碼)。
開始安裝
1、下載安裝包
在Oracle官網(wǎng)找到你想要下載的安裝包,由于2019年后java會開始收費,故我們只能使用java?8 固定版本。詳細參見?00.關于Java開始收費的說明,因此我們只選擇jdk1.8.0_181.rar之前的版本,并且只選擇小版本號為奇數(shù)(如8u191)的安裝包。
離線window x64的JDK壓縮包
2、安裝
linux和windows都可以下載安裝版和壓縮包,安裝過程略過。個人推薦壓縮包,下載后解壓即可。
3、配置環(huán)境變量
Windows
在Windows上需要配置的環(huán)境變量為JAVA_HOME、Path和Classpath(Classpath在Java1.5之后可以不設置)
JAVA_HOME: 全路徑,指向你的JDK目錄,注意,一定是jdkXXX這種目錄
Path: .;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;%JAVA_HOME%\bin; (不要忘了前面的小點)
Linux
在Linux下配置環(huán)境變量需要注意,你需要根據(jù)你的實際情況選擇是配置全局的環(huán)境變量還是該用戶下的環(huán)境變量。全局環(huán)境變量請修改/etc/propfile,用戶環(huán)境變量請修改~/.bash_profile
在上述文件末尾加入:
export JAVA_HOME=/usr/opt/java/jdkXXX
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
保存后執(zhí)行source 你剛剛修改的文件
至此,配置完畢,請打開控制臺輸入javac命令驗證。若出現(xiàn)響應則說明配置成功,若出現(xiàn)“不能識別的指令”則說明配置失敗,請按照上文修改。
請問華碩A40的本能裝Linux網(wǎng)卡驅動嗎?
ethtool -a eth0 查看網(wǎng)卡 ethtool -A eth1 autoneg off rx off tx off 關閉網(wǎng)卡流控制 ethtool -K eth1 rx off tx off 關閉網(wǎng)卡效驗 /etc/init.d/network restart 重新啟動網(wǎng)卡 ifconfig 查看網(wǎng)卡屬性 本帖最后由 xieoqm 于 2011-6-8 00:42 編輯 以下是方法解決。(命令可以復制到putty中執(zhí)行) 刪除更新的網(wǎng)卡驅動 rm -fr /lib/modules/$(uname -r)/updates/sk98lin.ko depmod -a #改網(wǎng)卡流控 echo -n 'for ethname in $(hintget vdisk_ethlist | tr '\'','\'' '\'' '\''); do echo $ethname; ethtool -A $ethname automeg off rx off tx off; ethtool -K $ethname rx off tx off; done' /etc/rc.local /etc/rc.local 重網(wǎng)絡服務和我們的程序 /etc/init.d/network restart hh restart hv restart 如果還不行,reboot 重起無盤服務器
安裝好了BT5和虛擬機,虛擬機也漢化了但是檢測不到網(wǎng)卡。求大神解釋。
如果你是USB外接網(wǎng)卡就在虛擬機中把網(wǎng)卡加載進來,詳見附件教程!如果你是筆記本內置網(wǎng)卡你可以嘗試如下操作,但是有可能網(wǎng)卡驅動不兼容。
虛擬機linux系統(tǒng)安裝網(wǎng)卡驅動方法
1.將網(wǎng)卡驅動考入U盤。
2.在真機種運行services.msc。將VMware USB Arbitration Service服務開啟。這樣才能使linux系統(tǒng)讀到U盤。
3.在linux系統(tǒng)下輸入命令:mount /dev/sda1 /mnt ? dev/sda1在這里是U盤設備名,根據(jù)自己實際情況輸入。將U盤掛載到/mnt目錄下。
4.cd /mnt
5.cp XX / ?復制并移動網(wǎng)卡驅動到根目錄。其中XX表示網(wǎng)卡驅動名。
6.tar -zxvf XX 解壓網(wǎng)卡驅動
7.cd XX
8.cd src
9.make 編譯
10.make install 安裝
11.insmod XX 加載驅動
12.修改eth0信息
cd /etc/sysconfig/network-scripts;
cp ifcfg-lo ifcfg-eth0;
vi ifcfg-etho;
修改后保存退出。
13.這樣網(wǎng)卡驅動就安裝完成了。
文章名稱:關于linux啟動jmc命令的信息
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