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TCGA 數(shù)據(jù)下載
通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時候出現(xiàn)了以下的報錯：
gdc-client軟件安裝和配置
下載軟件地址：https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool，根據(jù)自己的操作系統(tǒng)下載對應(yīng)的版本，這里下載Mac版本。
將下載的軟件解壓，并放在一個自己好找的目錄，例如我放在了Documents/TCGA數(shù)據(jù)下載中
下載數(shù)據(jù)
在GDC官網(wǎng)：https://portal.gdc.cancer.gov 中找到自己所需要的數(shù)據(jù)，比如HNSC的miRNA數(shù)據(jù)。然后下載Manifest到剛剛軟件放置的目錄 先點擊Exploration，然后在左側(cè)選取需要的癌癥類型和項目，選好后點擊View Files in Repository
然后打開終端，在終端輸入
./gdc-client download -m gdc_manifest.2020-08-11.txt -d ./HNSC/ 就開始下載啦~
到此，關(guān)于“通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時報錯怎么辦”的學(xué)習(xí)就結(jié)束了，希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學(xué)習(xí)，快去試試吧！若想繼續(xù)學(xué)習(xí)更多相關(guān)知識，請繼續(xù)關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站，小編會繼續(xù)努力為大家?guī)砀鄬嵱玫奈恼拢?/p>
本文名稱：通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時報錯怎么辦
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